Las penas del Agente Smith : Lo que mil dolores de cabeza me enseñaron sobre organizar mis proyectos de investigación [fuente]


18/06/2013

Durante estos años dedicado al mundo de la investigación he aprendido muchas cosas. Entre las más importantes, a ordenar.

La organización de los datos, documentos y programas relacionados con un proyecto de investigación es de tal importancia que si no le prestamos suficiente atención podemos sufrir de análisis que aparecen sin saber de dónde vienen, datos extraviados, figuras generadas a partir de datos antiguos y todo lo anterior más otras pesadillas que no voy a relatar aquí porque me quedaría sin espacio. Se lo digo por experiencia.

La mayoría de las tareas que se pueden llevar a cabo para mejorar la organización de un proyecto suenan a perogrullo en cuanto se leen, pero sigan conmigo y es posible que vean que muchas de ellas no se les habían pasado por la cabeza o no sabían que les podían solucionar tanto la vida.

Como dos referencias principales utilizaré este artículo de blog y este otro publicado en PLOS Computational Biology. Juntos constituyen un buen resumen de lo que se debería tener en cuenta antes de empezar siquiera a guardar los primeros datos.

Empecemos por la estructura de directorios. En el artículo de PLOS se sugiere el siguiente esquema:

journal.pcbi.1000424.g001Como siempre en estos casos, cada proyecto es un mundo y cada laboratorio tiene sus propias idiosincrasias que nos empujan a hacer las cosas de una forma o de otra. Lo importante es la idea:

  • Los datos están aislados en su propio directorio. En el ejemplo, además, están organizados según la fecha de adquisición.
  • Los programas que se utilizan para el procesamiento están también en su propio directorio separado. Se separa el código fuente de los ejecutables, si se da el caso de que utilizamos lenguajes compilados.
  • Los resultados que vamos obteniendo también van a su propio directori[...]

Las penas del Agente Smith : Lo que mil dolores de cabeza me enseñaron sobre organizar mis proyectos de investigación [fuente]


18/06/2013

Durante estos años dedicado al mundo de la investigación he aprendido muchas cosas. Entre las más importantes, a ordenar.

La organización de los datos, documentos y programas relacionados con un proyecto de investigación es de tal importancia que si no le prestamos suficiente atención podemos sufrir de análisis que aparecen sin saber de dónde vienen, datos extraviados, figuras generadas a partir de datos antiguos y todo lo anterior más otras pesadillas que no voy a relatar aquí porque me quedaría sin espacio. Se lo digo por experiencia.

La mayoría de las tareas que se pueden llevar a cabo para mejorar la organización de un proyecto suenan a perogrullo en cuanto se leen, pero sigan conmigo y es posible que vean que muchas de ellas no se les habían pasado por la cabeza o no sabían que les podían solucionar tanto la vida.

Como dos referencias principales utilizaré este artículo de blog y este otro publicado en PLOS Computational Biology. Juntos constituyen un buen resumen de lo que se debería tener en cuenta antes de empezar siquiera a guardar los primeros datos.

Empecemos por la estructura de directorios. En el artículo de PLOS se sugiere el siguiente esquema:

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  • Los datos están aislados en su propio directorio. En el ejemplo, además, están organizados según la fecha de adquisición.
  • Los programas que se utilizan para el procesamiento están también en su propio directorio separado. Se separa el código fuente de los ejecutables, si se da el caso de que utilizamos lenguajes compilados.
  • Los resultados que vamos obteniendo también van a su propio directori[...]

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18/06/2013

Durante estos años dedicado al mundo de la investigación he aprendido muchas cosas. Entre las más importantes, a ordenar.

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La mayoría de las tareas que se pueden llevar a cabo para mejorar la organización de un proyecto suenan a perogrullo en cuanto se leen, pero sigan conmigo y es posible que vean que muchas de ellas no se les habían pasado por la cabeza o no sabían que les podían solucionar tanto la vida.

Como dos referencias principales utilizaré este artículo de blog y este otro publicado en PLOS Computational Biology. Juntos constituyen un buen resumen de lo que se debería tener en cuenta antes de empezar siquiera a guardar los primeros datos.

Empecemos por la estructura de directorios. En el artículo de PLOS se sugiere el siguiente esquema:

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  • Los datos están aislados en su propio directorio. En el ejemplo, además, están organizados según la fecha de adquisición.
  • Los programas que se utilizan para el procesamiento están también en su propio directorio separado. Se separa el código fuente de los ejecutables, si se da el caso de que utilizamos lenguajes compilados.
  • Los resultados que vamos obteniendo también van a su propio directori[...]

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18/06/2013

Durante estos años dedicado al mundo de la investigación he aprendido muchas cosas. Entre las más importantes, a ordenar.

La organización de los datos, documentos y programas relacionados con un proyecto de investigación es de tal importancia que si no le prestamos suficiente atención podemos sufrir de análisis que aparecen sin saber de dónde vienen, datos extraviados, figuras generadas a partir de datos antiguos y todo lo anterior más otras pesadillas que no voy a relatar aquí porque me quedaría sin espacio. Se lo digo por experiencia.

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Como dos referencias principales utilizaré este artículo de blog y este otro publicado en PLOS Computational Biology. Juntos constituyen un buen resumen de lo que se debería tener en cuenta antes de empezar siquiera a guardar los primeros datos.

Empecemos por la estructura de directorios. En el artículo de PLOS se sugiere el siguiente esquema:

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  • Los programas que se utilizan para el procesamiento están también en su propio directorio separado. Se separa el código fuente de los ejecutables, si se da el caso de que utilizamos lenguajes compilados.
  • Los resultados que vamos obteniendo también van a su propio directori[...]

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18/06/2013

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  • Los datos están aislados en su propio directorio. En el ejemplo, además, están organizados según la fecha de adquisición.
  • Los programas que se utilizan para el procesamiento están también en su propio directorio separado. Se separa el código fuente de los ejecutables, si se da el caso de que utilizamos lenguajes compilados.
  • Los resultados que vamos obteniendo también van a su propio directori[...]

Las penas del Agente Smith : Lo que mil dolores de cabeza me enseñaron sobre organizar mis proyectos de investigación [fuente]


18/06/2013

Durante estos años dedicado al mundo de la investigación he aprendido muchas cosas. Entre las más importantes, a ordenar.

La organización de los datos, documentos y programas relacionados con un proyecto de investigación es de tal importancia que si no le prestamos suficiente atención podemos sufrir de análisis que aparecen sin saber de dónde vienen, datos extraviados, figuras generadas a partir de datos antiguos y todo lo anterior más otras pesadillas que no voy a relatar aquí porque me quedaría sin espacio. Se lo digo por experiencia.

La mayoría de las tareas que se pueden llevar a cabo para mejorar la organización de un proyecto suenan a perogrullo en cuanto se leen, pero sigan conmigo y es posible que vean que muchas de ellas no se les habían pasado por la cabeza o no sabían que les podían solucionar tanto la vida.

Como dos referencias principales utilizaré este artículo de blog y este otro publicado en PLOS Computational Biology. Juntos constituyen un buen resumen de lo que se debería tener en cuenta antes de empezar siquiera a guardar los primeros datos.

Empecemos por la estructura de directorios. En el artículo de PLOS se sugiere el siguiente esquema:

journal.pcbi.1000424.g001Como siempre en estos casos, cada proyecto es un mundo y cada laboratorio tiene sus propias idiosincrasias que nos empujan a hacer las cosas de una forma o de otra. Lo importante es la idea:

  • Los datos están aislados en su propio directorio. En el ejemplo, además, están organizados según la fecha de adquisición.
  • Los programas que se utilizan para el procesamiento están también en su propio directorio separado. Se separa el código fuente de los ejecutables, si se da el caso de que utilizamos lenguajes compilados.
  • Los resultados que vamos obteniendo también van a su propio directori[...]